Для работы с реестром из командной строки есть утилита reg.exe, которая поставляется вместе с дистрибутивом Windows которая поставляется в составе Support Tools
Для получения справки о работе с утилитой reg.exe выполните в командной строке cmd
reg /?
Допустим, в разделе HKCU\Software\palexa\Test есть параметр с именем Path, типом данных REG_EXPAND_SZ и значением %systemroot%. Вам нужно изменить значение с %systemroot% на %temp%. Для этого будем использовать следующую команду:
REG ADD HKCU\Software\palexa\Test /v Path /t REG_EXPAND_SZ /d %"temp"%
Таким образом, Вы замените значение параметра Path с одного на другое.
Важно обратить внимание на то, что команда ожидает от пользователя подтверждения. Чтобы отключить это подтверждение добавьте в указанную команду /f
REG ADD HKCU\Software\palexa\Test /v Path /t REG_EXPAND_SZ /d %"temp"% /f