Допустим Вы подозреваете что в файлы вашего сайта были внесены изменения, и найти такие файлы вручную это долго и затруднительно. Так что делать если надо найти изменённые файлы.
Можно провести поиск файлов, по критерию, что было и что стало. То есть отличия от оригинала. Например поиск файлов изменённых в движке сайта на предмет вредоносного кода
Допустим есть две папки joomla-clean, которая содержит оригинальную ранее установленную копию joomla и joomla-compr, которая содержит угрозу где-то в файлах.
Можно найти различия в папках, между установленной joomla и чистой joomla, исключив при этом папку templates, выполнив команду:
diff -r joomla-clean/ joomla-compr/ -x templates
Поиск файлов - как найти недавно изменённые файлы в Linux